经颅多普勒仪在神经系统疾病中的作用尤为突出。对于中风患者，该仪器可以预测中风风险，并评估脑血管状态。其无创、快速的特性使其成为中风急性期筛查和检测的有效工具。
对于脑血管痉挛，尤其是动脉瘤破裂导致的脑血管痉挛，经颅多普勒提供了非侵入性的检测方法。通过检测，可以及时发现和干预，这对减少脑损伤并改善预后具有重要意义。
在心血管领域，经颅多普勒也发挥着重要作用。其能够检测心脏疾病患者潜在的脑血流变化，帮助医生制定更加有效的治疗方案。此外，对于产后女性，该仪器可以检测产后脑血管并发症，是发现产后心脑血管问题的有力保障。
除了神经和心血管领域，经颅多普勒在眼科、耳鼻喉科的研究中也有应用。眼科中，它用于检测视网膜血流状态，提高青光眼等疾病的早期发现的可能。耳鼻喉科则借助其评估椎基底动脉供血失常，与梅尼埃病检测结合。
