儿童骨密度计不同于普通成人仪器，需要特别考虑设计和结构。首先，仪器应适应儿童的身体特点，扫描探头和支架应特别设计，以确保使用过程的安全和舒适。超声波骨密度计应具有适合儿童操作的交互界面和过程简化。
此外，儿童在测试时往往缺乏耐心。因此，操作简单快捷的仪器可以有效缩短测试时间，提高测试的合作性。同时，一些友好的图形设计和动画反馈也有助于缓解孩子的紧张情绪，有利于测试过程的顺利进行。
安全一直是儿童医疗设备采购的重要考虑因素之一。理想的骨密度计应尽量减少对儿童的潜在伤害，以确保足够的敏感性和精度。如果使用超声波骨密度计，应注意其声波强度和频率设置，以免给儿童造成身体不适。此外，设备的机械设计应无尖角，材料应符合国际环保标准，避免“二次伤害”的风险。
